V místech současného Chlumu stával kdysi poplužní dvůr, kolem něhož vznikla osada, která patřila Rožmbekům. Toto vlastnictví dokládají zmínky z roku 1399 a 1410. Městys se rozkládá na břehu rybníku Hejtman, založený v 16. století pod vedením rybníkáře Mikuláše Rutharda. V roce 1704 dědí chlumecké panství rod Fünfkirchenů. Ti přestavěli tvrz na barokní zámeček. V roce 1745 postavili kostel, zasvěcený Nanebevzetí Panny Marie. Zámeček a kostel spojuje Křížová cesta. V roce 1875 zdědil panství následník trůnu František Ferdinand dˇEste který zámek přestavěl na letní sídlo a vytvořil kolem něj krajinářsky významný park s exotickými dřevinami. V 15. století se zde začala těžit železná ruda, v 18. století zde byla založena jedna z největších železáren v jižních Čechách. Chlum však nejvíce proslavila sklářská výroba, první zmínky pochází z roku 1767. V současné době se stal Chlum u Třeboně vyhledávaným letoviskem v CHKO Třeboňsko.
