První zmínka o obci je z roku 1228, kde se obec připomíná jako zboží kláštera sv. Jiří v Praze. V Chotiměři byly dvě tvrze, z nichž jedna byla vodní a její půdorysní pozůstatky jsou patrné dodnes. Dva statky tu byly již na samém začátku XV. století. Jeden statek náležel Zdeněku ze Vchynic. V r. 1492 patřil jeden statek Janu a Václavu isterským ze Sulevic. Z erbů těchto rodů vychází znak a prapor obce které ji náleží od r. 2003. Jméno obce Chotiměř (Chotimiř, Chodomiř) připomíná strážní (chodskou) službu v pomezním hvozdu. K památkám patří barokní kaplička na návsi z 18. století a selské stavení z téhož období. V obci je obchod se smíšeným zbožím a hostinec. Další hostinec "Černodolský mlýn" se nachází v Oparenském údolí při cyklotrase z Malých Žernosek k Chotiměři a Vilemínu. Dále lze v obci najít mateřskou školu, místní knihovnu s veřejným internetem, pilu, autodopravu a farmu, která je převážně zaměřena na sadařství. Železniční stanice Chotiměř leží na trati Lovosice-Teplice, odkud mohou turisté vyjít do Oparenského údolí i na Milešovku. Obec je položena mezi nejvyššími kopci Českého Středohoří Milešovkou, Kletečnou, Lovošem. Leží při silnici z Vilemína do Libochovic. Protéká jí potok Chotiměřský pramenící na Hrušové, který se v opárenském údolí vlévá do potoka Milešovského.